Ejo wurde in Kyoto in die Adelsfamilie der Fujiwara geboren.
Er ordinierte 1215 als Tendaimönch bei Meister Enno in Yokawa.
Im Jahr 1234 wurde er Schüler von Dogen Zenji und erhielt 1236 die Dharmaübertragung von ihm.
Nach Dogens Tod 1253 wurde Ejo sein Nachfolger als Abt, in dem von ihm gegründeten Eiheiji. Auch war Ejo maßgeblich an den Aufzeichnungen von Dogens Werken beteiligt.
